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最新版生物標(biāo)志物丨腫瘤常見分子標(biāo)志物之BRAF
BRAF生物學(xué)意義[1]
BRAF基因編碼B-RAF,它是一種參與細(xì)胞信號傳導(dǎo),生長和存活的蛋白質(zhì)。常見的BRAF V600E突變會導(dǎo)致B-RAF單體的組成性活化,并隨后激活MEK1和MEK2,導(dǎo)致的結(jié)果就是:增加細(xì)胞增殖和抑制細(xì)胞凋亡。
BRAF V600變會導(dǎo)致BRAF激酶及其下游信號RAS-RAF-MEK-ERK(MAPK)的持續(xù)性激活,引起腫瘤細(xì)胞分化增殖、代謝、生長的改變。
RAS-RAF-MEK-ERK(MAPK)通路
BRAF除了常見V600E突變外還有很多其他的突變形式,其中許多突變具有相同的功能意義(但有些則不然)。
BRAF的臨床意義
通常在患有癌癥的患者中都會發(fā)生BRAF突變,比如:
黑色素瘤:40%~60%;
甲狀腺癌:10%~70%(取決于組織學(xué)分類);
結(jié)直腸癌(CRC):10%;
非小細(xì)胞肺癌(NSCLC):3%~5%。
常見BRAF基因突變
BRAF V600D/E/K/R突變(I類突變體)導(dǎo)致BRAF激酶活性的強烈激活,MAPK途徑的組成性激活以及對BRAF和MEK抑制劑的敏感性。
BRAF常見的氨基酸、堿基變化及COSMIC ID號和突變頻率
BRAF K601,L597,G464和G469突變是位于激活區(qū)段或P-環(huán)和RAS非依賴性二聚體信號中的II類突變體的類型。
BRAF G466,N581,D594和D596突變是位于P-環(huán),催化環(huán)或DFG基礎(chǔ)激酶活性中III類突變體的類型,并且具有低于野生型BRAF激酶活性或缺乏BRAF激酶活性。
BRAF的適用腫瘤
甲狀旁腺癌,結(jié)直腸癌(CRC),皮膚黑色素瘤,原發(fā)性未知的胃腸神經(jīng)內(nèi)分泌癌、非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)、乳頭狀癌、小腸癌。
當(dāng)前FDA批準(zhǔn)BRAF藥物適應(yīng)癥
一、達(dá)拉非尼(Dabrafenib):
· BRAF V600E突變的不可切除或轉(zhuǎn)移性黑色素瘤[2]。
二、達(dá)拉非尼+曲美替尼(Dabrafenib + trametinib):
· 輔助治療淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移切除后BRAF V600E或V600K突變的黑色素瘤患者[3];
· BRAF V600E或BRAF V600K突變無法切除或轉(zhuǎn)移的黑色素瘤[4,5]。
· BRAF V600E突變的轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌[6,7]。
· BRAF V600E突變的局部進展晚期或轉(zhuǎn)移性未分化甲狀腺癌(沒有令人滿意的局部治療選擇)[8]。
三、曲美替尼(Trametinib):
· BRAF V600E或BRAF V600K突變無法切除或轉(zhuǎn)移的黑色素瘤[9]。
四、維莫非尼(Vemurafenib):
· BRAF V600E突變的不可切除或轉(zhuǎn)移性黑色素瘤[10,11]。
五、維莫非尼+卡比替尼(Vemurafenib + cobimetinib):
· BRAF V600E或BRAF V600K突變無法切除或轉(zhuǎn)移的黑色素瘤[12]。
最近的數(shù)據(jù)表明,西妥昔單抗/伊立替康聯(lián)合維莫非尼對攜帶BRAF V600 突變的轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌(mCRC)是有效的(尚未明確)[13]。
BRAF的檢測建議
對于黑色素瘤患者,應(yīng)在開始使用BRAF抑制劑治療前進行BRAF V600E和BRAF V600K的檢測。
對于非小細(xì)胞肺癌患者,應(yīng)在開始使用BRAF抑制劑治療前進行BRAF V600E檢測。
對于結(jié)直腸癌患者,BRAF突變的檢測應(yīng)在診斷腫瘤轉(zhuǎn)移時進行,這可以用來指導(dǎo)后續(xù)的治療決策。BRAF V600E突變表示對帕尼單抗(panitumumab)和西妥昔單抗(cetuximab)的響應(yīng)率低;一些指南建議為這些患者增加使用維莫非尼。
BRAF的檢測有多種檢測方法可供選擇,包括已批準(zhǔn)的伴隨診斷產(chǎn)品和經(jīng)過CLIA認(rèn)證開發(fā)用于BRAF檢測的實驗室;基于DNA的檢測和基于抗體的檢測都是可行的;一些專為BRAF V600E突變而開發(fā)設(shè)計的檢測方法,以及其他可以檢測多種BRAF突變的檢測方法[14]。
FDA批準(zhǔn)BRAF伴隨診斷產(chǎn)品
FoundationOne CDx:基于NGS檢測平臺,檢測的樣本類型為腫瘤組織FFPE樣本,檢測包含BRAF在內(nèi)的324個基因,是NSCLC(達(dá)拉非尼+曲美替尼)、黑色素瘤(達(dá)拉非尼;曲美替尼/卡比替尼+維莫非尼;維莫非尼)臨床用藥伴隨診斷產(chǎn)品。
Oncomine Dx Target Test:基于NGS檢測平臺,檢測的樣本類型為腫瘤組織FFPE樣本,定性檢測包含BRAF在內(nèi)的23個基因單核苷酸變異,是NSCLC(達(dá)拉非尼+曲美替尼)臨床用藥伴隨診斷產(chǎn)品。
THxID BRAF Kit:基于實時熒光定量PCR檢測平臺,定性檢測BRAF V600E和V600K,是黑色素瘤的達(dá)拉非尼(V600E)和曲美替尼(V600E/V600K)臨床用藥伴隨診斷產(chǎn)品。
cobas 4800 BRAF V600 Mutation Test:基于實時熒光定量PCR檢測平臺,定性檢測BRAF V600E,是黑色素瘤的維莫非尼臨床用藥伴隨診斷產(chǎn)品
武漢紐斯特生物科技有限公司(Wuhan NewEast Biotechonology Co.Ltd),系美國知名生命科學(xué)試劑供應(yīng)商美國NewEastBio在中國的子公司。公司位于武漢東湖高新技術(shù)開發(fā)區(qū)光谷生物城. 美國NewEastBio專注于生命科學(xué)和生物技術(shù)領(lǐng)域,主要產(chǎn)品有抗體、小分子、ELISA試劑盒、蛋白等,與世界著名高校和研究所、世界大制藥公司、生物科技公司和醫(yī)院等客戶建立了長期穩(wěn)定的合作關(guān)系,產(chǎn)品銷往全球。
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